Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC18A3Q16572 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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