Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F4Q16254 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F4Q16254 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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