Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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SNCBQ16143 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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