Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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