Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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NCOA1Q15788 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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