Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIP10Q15642 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms