Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF1Q15361 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms