Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms