Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKX1-1Q15270 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms