Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPAQ15257 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPAQ15257 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms