Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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