Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3GAP1Q15042 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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