Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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