Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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