Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SQLEQ14534 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SQLEQ14534 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms