Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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