Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOFQ13790 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOFQ13790 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
APOFQ13790 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOFQ13790 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOFQ13790 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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APOFQ13790 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOFQ13790 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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