Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC1Q13547 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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