Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN4PQ13434 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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