Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPA4Q13156 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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