Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RESTQ13127 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RESTQ13127 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RESTQ13127 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RESTQ13127 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RESTQ13127 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RESTQ13127 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RESTQ13127 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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