Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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