Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IFT88Q13099 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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