Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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