Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACACAQ13085 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACACAQ13085 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms