Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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