Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STX4Q12846 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STX4Q12846 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STX4Q12846 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STX4Q12846 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
STX4Q12846 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
STX4Q12846 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STX4Q12846 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
STX4Q12846 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STX4Q12846 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STX4Q12846 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STX4Q12846 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
STX4Q12846 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STX4Q12846 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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STX4Q12846 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STX4Q12846 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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