Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFEMP1Q12805 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms