Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMA1Q12791 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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