Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBRQ0VD83 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms