Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
GOLGA3Q08378 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GOLGA3Q08378 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms