Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCN1BQ07699 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms