Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms