Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms