Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GBE1Q04446 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GBE1Q04446 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms