Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms