Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC10Q01780 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC10Q01780 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms