Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFITM3Q01628 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms