Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM2Q00987 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms