Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK3Q00526 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK3Q00526 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms