Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDLBPQ00341 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms