Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms