Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA4AP68366 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA4AP68366 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBA4AP68366 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA4AP68366 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms