Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3BP58499 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms