Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms