Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRCA2P51587 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRCA2P51587 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms