Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SMARCA2P51531 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA2P51531 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA2P51531 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms