Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB5CP51148 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms