Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSEN1P49768 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSEN1P49768 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms