Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFMP43652 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFMP43652 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFMP43652 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFMP43652 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFMP43652 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFMP43652 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFMP43652 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFMP43652 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFMP43652 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms